La missione principale del Centro di ricerca scientifica di Capodistria è diventare un centro di riferimento per le attività di ricerca e sviluppo scientifico nei campi e nelle discipline scientifiche studiate e sviluppate dai suoi nove istituti.
Nell’ambito del Centro di ricerca scientifica di Capodistria operano dieci unità infrastrutturali che, insieme agli istituti, perseguono l’obiettivo di creare un ambiente stimolante per i ricercatori e di consentire una ricerca di alta qualità sulle questioni contemporanee della società, contribuendo al suo benessere.